Le Parc du Doubs comprend quinze communes, qui figurent parmi les membres premiers de l’association. Les voici, d’ouest en est : Le Locle et La Chaux-de-Fonds dans le canton de Neuchâtel, La Ferrière dans le canton de Berne, ainsi que Les Bois, Le Noirmont, Muriaux, Les Breuleux, Saignelégier, Les Enfers, Montfaucon, Soubey, Les Genevez, Lajoux, Saint-Brais et Clos du Doubs dans le canton du Jura.
Sont également membres du Parc du Doubs de nombreuses associations locales et régionales de protection de l’environnement, des groupes d’intérêts et des organisations professionnelles de divers secteurs (agriculture, sylviculture, pêche et tourisme). Des particuliers peuvent par ailleurs devenir membres individuels pour faire bénéficier l’association de leur expérience, proposer de nouvelles idées et défendre les intérêts du parc.
